Εξειδίκευση τύπου :	Άρθρο σε επιστημονικό περιοδικό
Τίτλος:	A combined NMR and molecular dynamics simulation study to determine the conformational properties of agonists and antagonists against experimental autoimmune encephalomyelitis
Δημιουργός/Συγγραφέας:	Mantzourani, Efthimia D. Blokar, Klemen Tselios, Theodore V. Matsoukas, John M. Platts, James A. [EL] Μαυρομούστακος, Θωμάς[EN] Mavromoustakos, Thomas Grdadolnik, Simona Golic
Εκδότης:	Pergamon
Τόπος έκδοσης:	OXFORD
Ημερομηνία:	2008-03-01
Γλώσσα:	Αγγλικά
ISSN:	0968-0896
DOI:	10.1016/j.bmc.2007.11.083
Περίληψη:	Myelin basic protein (MBP) is one of the best characterized autoantigens causing multiple sclerosis (MS), via a procedure that involves a stable formation of the trimolecular complex of a T-cell Receptor (TCR), an MBP epitope, and the receptor HLA-DR2b. Experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) is considered as an instructive model for MS in humans, and plenty of X-ray data is available for a number of EAE inducing peptide-receptor complexes. To date, though, there are no data available for complexes involving peptides reversing EAE, namely antagonists. Conformational properties of the EAE inducing epitope MBP87-99 were analyzed in DMSO using the NOE connectivities and vicinal H-N-H-alpha coupling constants, and compared with the antagonist altered peptide ligands. A robust method, which is based on a combination of molecular dynamics and energy minimization, is proposed for identifying the putative bioactive conformations. Generated conformations are compared with the known X-ray structure of MBP83-96 (human sequence numbering) in the HLA-DR2b complex. The structural motif for the agonist-antagonist activity is discussed.
Τίτλος πηγής δημοσίευσης:	Bioorganic & Medicinal Chemistry
Τόμος/Κεφάλαιο:	16
Τεύχος:	5
Σελίδες:	2171-2182
Θεματική Κατηγορία:	[EL] Βιολογία (Γενικά)[EN] Biology (General) [EL] Χημεία (Γενικά)[EN] Chemistry (General) [EL] Οργανική χημεία[EN] Organic chemistry [EL] Φαρμακευτική[EN] Pharmacy and materia medica
Λέξεις-Κλειδιά:	NMR molecular dynamics bioactive conformation agonist-antagonist activity Chemistry, Medicinal
Αξιολόγηση από ομότιμους (peer reviewed):	Ναι
Κάτοχος πνευματικών δικαιωμάτων:	© 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Ηλεκτρονική διεύθυνση περιοδικού (link) :	http://www.elsevier.com/locate/bmc
ΙΒΦΧΒ: αρχειακή συλλογή:	Ινστιτούτο Οργανικής και Φαρμακευτικής Χημείας (ΙΟΦΧ) (έως 2012)
Εμφανίζεται στις συλλογές:	Ινστιτούτο Χημικής Βιολογίας - Επιστημονικό έργο